Introduction
Durant la période de la pandémie Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), la prise en charge des patients présentant des symptômes typiques pour Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) avec un frottis nasopharyngé PCR négatif constitue un enjeu majeur pour les médecins de premiers recours. L’attitude diagnostique et thérapeutique, les conseils d’isolement et le suivi de ces patients peuvent s’avérer complexes, surtout si l’infection à SARS-CoV-2 est possible, alors que le résultat de la PCR du frottis nasopharyngé suggère le contraire.1
Ce qu’on sait
- La performance analytique PCR SARS-CoV-2 sur le frottis nasopharyngé est excellente dans les laboratoires suisses.1
- Cependant, la sensibilité diagnostique dépend de plusieurs paramètres, comme la qualité et la technique du prélèvement, la charge virale au site du prélèvement, le moment de l’examen par rapport à celui de l’exposition ou le début des symptômes, ainsi que les systèmes touchés.
- La sensibilité diagnostique de la PCR SARS-CoV-2 sur le frottis nasopharyngé varie en fonction des études, et les valeurs prédictives du test peuvent être estimées entre 70 et 98 % en fonction de la prévalence de la maladie ou la probabilité prétest.2
- La probabilité d’un test PCR SARS-CoV-2 faux négatif sur frottis nasopharyngé est très haute les premiers jours après une infection. Cette probabilité arrive au minimum 1 semaine après l’exposition et elle recommence à augmenter par la suite avec le temps.3
- En cas de probabilité prétest élevée et une PCR SARS-CoV-2 sur frottis nasopharyngé négative, une deuxième PCR pourrait être considérée.1
- En cas de persistance d’une probabilité élevée de COVID-19 et malgré des PCR sur frottis nasopharyngé négatives, une sérologie d’immunoglobulines de type G (IgG) pourrait être considérée à condition qu’elle soit effectuée minimum 2 semaines après l’apparition des symptômes.2
Ce qu’on ignore encore
- La variation dans le temps de la performance des tests diagnostiques après une exposition au COVID-19 reste à préciser par des études et des méta-analyses futures, incluant des études solides avec une bonne validité interne et externe. Cela aura des implications concrètes dans la démarche diagnostique du COVID-19 pour la médecine de premiers recours.
- Des facteurs préanalytiques peuvent influencer de manière importante les performances diagnostiques des tests COVID-19. Des études sont nécessaires afin de préciser les procédures cliniques et paracliniques pouvant avoir un impact sur les valeurs prédictives de tests et de proposer ainsi des stratégies d’amélioration.
Conflit d’intérêts :
Les auteurs n’ont déclaré aucun conflit d’intérêts en relation avec cet article.
Implications pratiques
▪ Une deuxième PCR COVID-19 sur frottis nasopharyngé peut être indiquée si la première est négative en cas de probabilité prétest haute
▪ Les tests diagnostiques comme la PCR COVID-19 ainsi que la sérologie sont très utiles dans le contexte épidémiologique actuel, mais ils doivent être toujours interprétés en prenant en considération la prévalence du SARS-CoV-2 dans la population, la probabilité prétest en fonction des symptômes du patient et les manifestations cliniques4
